Работа Школы получила высокую оценку со стороны многих государств и фондов.
В 2003 году правительство Великобритании наградило основателя и директора Школы орденом Британской империи.
В 2002 году, когда Школа праздновала свой 10-летний юбилей, Генеральный секретарь Совета Европы Вальтер Швиммер наградил ее специальной медалью Совета Pro Merito.
В 2006 году Елена Немировская была награждена премией Фонда Хиросимы «За мир и культуру».
В 2008 году Елена Немировская стала кавалером французского Национального ордена «За заслуги».
В 2010 году Елена Немировская была награждена польской медалью Bene Merito. В 2014 году Лена Немировская стала кавалером ордена «За заслуги перед Республикой Польша».
В 2023 году Елена Немировская была награждена ежегодной премией Московской Хельсинкской группы за вклад в права человека и российское правозащитное движение.